La solución genómica de Biogen utiliza AWS para avanzar en la investigación de enfermedades neurológicas
2020
Desafío del sector
Para identificar posibles nuevas terapias contra enfermedades, encontrar nuevos objetivos genéticos y comprender mejor la biología de las enfermedades neurológicas, los investigadores necesitan una forma eficaz de analizar los más de 1 PB de datos del Biobanco del Reino Unido, un estudio a largo plazo de 500 000 individuos durante 30 años.
Como todos los grupos ya utilizaban la infraestructura de AWS, fue muy fácil trasladar los datos a través de un bucket a cada grupo que tenía una Amazon Virtual Private Cloud para utilizar los datos”.
David Sexton
Director sénior de tecnología e informática del genoma, Biogen
Solución de Biogen
Para analizar la enorme cantidad de datos médicos del Biobanco del Reino Unido -que van desde la secuenciación del exoma (regiones genéticas que codifican proteínas) hasta los biomarcadores plasmáticos y la información biográfica, Biogen sabía que “necesitaba contar con una solución informática que estuviera a la altura del manejo de datos a esta escala”, dice David Sexton, director senior de tecnología e informática del genoma. En busca de una solución que diera prioridad a la nube, Biogen se asoció con Databricks, un Socio tecnológico avanzadode Amazon Web Services (AWS) en la Red de socios de AWS (APN) y un socio con competencia en ciencias biológicas de AWS, y así diseñar una pila de soluciones de software que aprovechara AWS para analizar los datos de manera eficiente y segura. Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) proporciona la columna vertebral para el análisis de datos y el mantenimiento de la pila en la nube de AWS; Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) proporciona una solución de almacenamiento escalable para los crecientes petabytes de datos del proyecto; y Amazon Virtual Private Cloud (Amazon VPC) proporciona una sólida seguridad.
Beneficios de utilizar AWS
La arquitectura de AWS que utiliza Biogen le permitió trabajar sin esfuerzo con socios para analizar los datos. “Como todos los grupos ya utilizaban la infraestructura de AWS, fue muy fácil trasladar los datos a través de un bucket a cada grupo que tenía una Amazon Virtual Private Cloud para utilizar los datos”. Con la información recopilada a partir de los datos procesados por su pila de AWS, Biogen pudo reposicionar su cartera de fármacos basándose en pruebas genómicas, identificar nuevos objetivos farmacológicos y seguir descubriendo importante información sobre la base biológica de enfermedades neurodegenerativas como el Alzheimer y el Parkinson.
Sobre Biogen
Biogen es una empresa de ciencias biológicas dedicada a erradicar las enfermedades neurológicas. Ha sido pionera en la neurociencia y la biotecnología desde 1978, y su cartera abarca actualmente 60 tratamientos objetivo en ocho enfermedades.
Sobre Databricks
Databricks, socio tecnológico avanzado de AWS en la APN y socio de la competencia de ciencias biológicas de AWS, ofrece una plataforma de análisis de datos unificada que permite a los equipos de datos colaborar con herramientas de ingeniería de datos y ciencia de datos para acelerar la innovación basada en los mismos. Databricks también ofrece un paquete de soluciones genómicas que permiten el procesamiento de datos genómicos interactivos y el análisis a gran escala.
Introducción
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