Vertex Pharmaceuticals reduce los costes del almacenamiento y procesamiento de datos de criomicroscopía electrónica en un 50 % con AWS

Con la migración a AWS, Vertex migró sus cargas de trabajo más cerca del sitio de llegada de los datos a Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), un servicio de almacenamiento de objetos que ofrece escalabilidad, disponibilidad de datos, seguridad y rendimiento líderes en el sector. Vertex también utiliza Amazon FSx para Lustre, un almacenamiento compartido totalmente administrado e integrado en uno de los sistemas de archivos de alto rendimiento más populares del mundo, para ofrecer a los científicos la cantidad exacta de recursos de almacenamiento que necesitan durante un análisis activo.

Tras el procesamiento, Vertex vuelve a enviar los datos a Amazon S3. La empresa clasifica los datos de manera eficiente mediante las políticas del ciclo de vida de Amazon S3, conjuntos de reglas que definen las acciones que Amazon S3 aplica a un grupo de objetos. «Con las políticas del ciclo de vida de Amazon S3, podemos colocar los datos en diferentes niveles para reducir el coste de almacenamiento», afirma Iturralde. La empresa también puede escalar su almacenamiento sin problemas, lo que limita los gastos generales del centro de datos.

Para administrar la computación del procesamiento de datos, Vertex utiliza AWS ParallelCluster, una herramienta de administración de clústeres de código abierto que facilita la implementación y administración de clústeres de HPC elásticos en AWS. Activará y desactivará los nodos de HPC en función de las demandas del software de análisis. «Cuando terminen, podemos volver a pagar casi nada», advierte Iturralde. «No necesitamos preocuparnos de que el ritmo de la ciencia agote nuestros recursos o desvíe nuestra atención hacia el mantenimiento de la infraestructura».

Al hacer coincidir sus costes de computación con las demandas de carga de trabajo, Vertex redujo los costes en un 50 por ciento. También logró un rendimiento dos veces mejor que su arquitectura anterior. Además, Vertex eliminó los obstáculos a los que se enfrentaba su equipo de criomicroscopía electrónica en el entorno local a la hora de compartir los recursos con otros grupos, algo que hacía a menudo. «Antes, analizar los datos de criomicroscopía electrónica llevaba varias semanas, incluso cuando nadie más utilizaba los recursos», explica Posson. «Ahora, con AWS, podemos entregar datos de manera confiable en menos de 1 semana».

Vertex agregó la compatibilidad nativa con el inicio de sesión único mediante Amazon Cognito, que las empresas pueden utilizar para añadir el registro, el inicio de sesión y el control de acceso a las aplicaciones web y móviles de forma rápida y sencilla. «El uso de Amazon Cognito nos brinda la comodidad adicional de que solo los empleados correspondientes tengan acceso al software», señala Iturralde. Además, Vertex utiliza el equilibrador de carga de aplicación, que equilibra la carga del tráfico HTTP y HTTPS con un avanzado enrutamiento de solicitudes destinado a la entrega de aplicaciones modernas, para proteger su red.

En AWS, Vertex hizo que sus procesos sean eficientes, escalables y rentables, al mismo tiempo que reduce el mantenimiento manual. Basarse en AWS también significa que la empresa tiene acceso a los recursos informáticos y de GPU más recientes sin los meses de espera asociados a la adquisición de hardware para centros de datos. Por ejemplo, Vertex ejecuta instancias G5 de Amazon EC2, que ofrecen una potente combinación de capacidad de CPU, memoria de host y GPU. Mediante la ejecución de los procesos de criomicroscopía electrónica en la nube, los científicos pueden realizar análisis casi en tiempo real. Vertex utiliza el costes tiempo del microscopio con mayor eficiencia y facilita los avances científicos.