投稿日: Oct 2, 2018
この新しいクイックスタートでは、Illumina のデータ分析プラットフォームである、GENomics Complete Suite (DRAGEN CS) 用の Dynamic Read Analysis を AWS クラウドにおよそ 15 分でデプロイします。
DRAGEN CS は、次世代シークエンシング (NGS) データの超高速分析を可能にし、ゲノムデータの分析に必要な時間を大幅に短縮し、正確性を向上します。これには、マッピング、配列、並び替え、マーキングの複製、およびハプロタイプのバリアントの呼び出し用に高度に最適化されたアルゴリズムを提供するバイオインフォマティクスパイプラインが含まれます。これらのパイプラインには DRAGEN Germline V2、DRAGEN Somatic V2 (Tumor および Tumor/Normal)、DRAGEN Virtual Long Read Detection (VLRD)、DRAGEN RNA Gene Fusion, DRAGEN Joint Genotyping、GATK Best Practices が含まれます。
このクイックスタートは、高可用性のための 2 つのアベイラビリティゾーンをつなげる AWS 環境を構築し、スポットインスタンスとオンデマンドインスタンスのための 2 つの AWS Batch コンピューティング環境を提供します。これらの環境には、 ハードウェアアクセラレーションのため、フィールドプログラマブルゲートアレイ (FPGAs) に接続されている DRAGEN F1 インスタンスが含まれます。
開始方法:
- アーキテクチャと詳細を参照する
- ステップバイステップ手順についてデプロイメントガイドを参照する
GitHub からデプロイメントを自動化する
AWS CloudFormation テンプレートをダウンロードする
その他の AWS クイックスタートのリファレンスデプロイについては、
詳細なカタログをご覧ください。
クイックスタートは自動化されたリファレンスデプロイで、AWS ベストプラクティスに従い、AWS CloudFormation テンプレートを使用して AWS の主要テクノロジーをデプロイするうえで役立ちます。このクイックスタートは、Illumina が AWS のソリューションアーキテクトと協力して作成したものです。Illumina は、AWS アドバンスドテクノロジーパートナーです。