A Relay Therapeutics utiliza a AWS para acelerar a descoberta de medicamentos

A Relay Therapeutics é uma empresa de medicina de precisão que transforma o processo de descoberta de medicamentos ao aproveitar insights incomparáveis sobre movimento de proteínas. Antes de testar compostos promissores no laboratório, os cientistas precisam considerar um universo molecular de pontos de partida disponíveis, com cerca de 10 bilhões de compostos. Eles precisam filtrar esse extenso conjunto até chegar aos 100-200 compostos com maior probabilidade de se ligar ao alvo biológico.

Ao analisar mais compostos, crescem as chances de os cientistas encontrarem as moléculas corretas para testar no laboratório. Em um típico datacenter on-premises, com milhares de CPUs, a análise de bilhões de compostos poderia durar meses. A implantação de CPUs adequadas em um datacenter on-premises também seria proibitiva, em termos de custos, principalmente devido à natureza “explosiva” das análises.

Geralmente, em ambientes tradicionais de TI, as empresas farmacêuticas examinam virtualmente alguns milhões de compostos por vez. A Relay Therapeutics estava determinada a escalar esse número para bilhões e recorreu à Amazon Web Services (AWS) para cumprir o desafio. “O fator principal em escolher a AWS em vez de outros provedores em nuvem é o suporte que recebemos desde o início”, afirma Pat Walters, vice-presidente sênior de computação da Relay Therapeutics. “E ela continuou nos ajudando a tornar nossos processos mais eficientes.”

Na AWS, a empresa também simplificou a filtragem virtual para que os cientistas possam utilizar scripts de código aberto para iniciar a análise no AWS Batch. Os cientistas então analisam rapidamente os dados ao usufruírem de vantagens do Amazon Athena, um serviço de consulta sem servidor e sem infraestrutura para gerenciar. 

Pierce estima que as instâncias spot do Amazon EC2 reduzem os custos de computação em 50% em comparação com a execução de triagem virtual on-premises. A AWS e a Relay Therapeutics também construíram verificações de parâmetros no processo para evitar que os custos de análise excedam o valor do orçamento. “Somos alertados se um trabalho ultrapassa um determinado limite de despesas”, explica Walters. “Isso nos diz que um parâmetro está desativado para que possamos encerrar o trabalho ou fazer um ajuste em tempo real.”

Desde a implantação da solução de computação de alto desempenho da AWS, a Relay Therapeutics tem executado várias triagens de cinco bilhões de compostos. Devido à escalabilidade oferecida pela AWS, os cientistas podem executar a triagem em múltiplos instantâneos do mesmo alvo de proteína em movimento.  

Há alguns anos, a equipe da Relay Therapeutics não pensou que seria possível executar a triagem virtual na escala que a empresa atingiu agora, com cientistas analisando tabelas com bilhões de linhas. “Organizar uma tabela com bilhões de linhas não é um exercício simples”, enfatiza Walters. “Ao usar as tecnologias da AWS, podemos lidar com todas as informações eficientemente, o que nos auxilia na luta para atingir nosso objetivo final, obter medicamentos para pacientes mais rápido do que pensávamos ser possível.”