เอกสารประกอบ

บทแนะนำสอนการใช้งาน

  • เวิร์กช็อป HealthOmics แบบครบวงจร

    เริ่มต้นใช้งานเวิร์กโฟลว์และการจัดเก็บของ HealthOmics

  • บทช่วยสอน HealthOmics

    ที่เก็บข้อมูลโอเพ่นซอร์สบน GitHub พร้อมโค้ดตัวอย่างที่แสดงให้เห็นถึงวิธีการจัดเก็บ ประมวลผล และสืบค้นชุดข้อมูลจีโนมและชีวภาพโดยใช้ AWS HealthOmics

เครื่องมือ

เครื่องมือเวิร์กโฟลว์

เวิร์กโฟลว์การค้นพบยา

ใช้คอลเลกชั่นของเวิร์กโฟลว์ของ AWS HealthOmics นี้เพื่อเร่งการค้นพบยา

ตัวอย่างเวิร์กโฟลว์

สร้างเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวตามตัวอย่างเวิร์กโฟลว์โอเพ่นซอร์ส HealthOmics

Run Analyzer

Run Analyzer เป็นเครื่องมือเพิ่มประสิทธิภาพการทำงานที่ดึงข้อมูลบันทึก Manifest จาก CloudWatch และสร้างสถิติสำหรับการเรียกใช้ รวมถึงการใช้ CPU และหน่วยความจำสำหรับงานเวิร์กโฟลว์แต่ละงาน

WDL Linter

ใช้ HealthOmics WDL linter เพื่อตรวจจับข้อผิดพลาดของเวิร์กโฟลว์ทั่วไปก่อนที่จะเรียกใช้เวิร์กโฟลว์

Nextflow Linter

Lint สำหรับข้อผิดพลาด Nextflow ทั่วไปก่อนที่จะเรียกใช้สคริปต์เวิร์กโฟลว์

ECR Helper

ย้ายคอนเทนเนอร์ที่มีอยู่ไปยังที่เก็บ ECR ส่วนตัวของคุณโดยใช้เครื่องมือ ECR Helper

Re-run Tool

Re-run เก็บถาวรข้อมูลบันทึก Manifest CloudWatch

เครื่องมือพื้นที่เก็บข้อมูล

อ่านชุดตัวจัดการการถ่ายโอน

ดาวน์โหลดไฟล์จากชุดอ้างอิงหรืออ่านของ AWS HealthOmics ได้อย่างง่ายดาย

ตัวนำเข้าที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์

แอป CDK สาธิตสถาปัตยกรรมที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์ที่นำเข้าข้อมูลลงในที่เก็บลำดับ AWS HealthOmics โดยอัตโนมัติเมื่อวัตถุถูกสร้างขึ้นใน Amazon S3

ตัวสร้างการจัดเก็บ Manifest ตามลำดับ

สร้าง Manifest json สำหรับงานนำเข้าการจัดเก็บ AWS HealthOmics ตามลำดับ

ค้นหาชุดการอ่านซ้ำที่ซ้ำกันของการจัดเก็บตามลำดับ

ระบุชุดการอ่านที่ซ้ำกันที่เก็บไว้ในการจัดเก็บ AWS HelathOmics ตามลำดับ

โซลูชัน

มีอะไรใหม่

ประกาศรองรับการเข้าถึงการอ่านข้อมูลที่จัดเก็บข้ามบัญชีสำหรับ AWS HealthOmics
11/22/2024

เวิร์กโฟลว์ AWS HealthOmics รองรับการแคชการเรียกใช้และการเข้าถึงไฟล์ระดับกลางแล้ว
11/21/2024

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับการตรวจจับเวอร์ชัน DSL และ Nextflow แล้ว
08/13/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับพื้นที่เก็บข้อมูลแบบไดนามิกสำหรับเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวแล้ว
30/04/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับการแชร์ข้ามบัญชีสำหรับเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวแล้ว
04/30/24

AWS HealthOmics ประกาศการสนับสนุนสำหรับการจัดเก็บลำดับการอ่านผ่าน Amazon S3 API
04/15/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics มีข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับการทำงานของเวิร์กโฟลว์แล้ว
23/02/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับเวิร์กโฟลว์ Ultima Genomics DeepVariant Ready2Run แล้ว
05/02/24

ขณะนี้การจัดเก็บลำดับ AWS HealthOmics มี ETag ที่คำนวณอัตโนมัติสำหรับชุดการอ่านแล้ว
06/10/23

AWS HealthOmics มีให้บริการแล้วในภูมิภาคอิสราเอล (เทลอาวีฟ)
26/09/23

ขณะนี้ AWS HealthOmics มีเวิร์กโฟลว์สำหรับการจัดเก็บถาวรและการเก็บรักษาข้อมูลแล้ว
30/08/23

ขณะนี้ AWS HealthOmics รองรับการกำหนดเวอร์ชันของการจัดเก็บคำอธิบายประกอบแล้ว
15/08/23

AWS HealthOmics รองรับการแชร์ข้ามบัญชีของการจัดเก็บการวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์
15/08/23

โพสต์ในบล็อก

เร่งการค้นคว้ายาด้วย AWS HealthOmics และ NVIDIA Blueprints
10/07/2024

การสร้างเวิร์กเบนช์ชีวสารสนเทศที่ปลอดภัยและใช้โค้ดต่ำบน AWS HealthOmics
10/02/2024

ปฏิวัติชีววิทยาเชิงกำเนิดด้วย AWS และ EvolutionaryScale
06/25/2024

Takeda Pharmaceuticals ช่วยเร่งสารสนเทศทางชีวภาพขนาดใหญ่ด้วย AWS HealthOmics ได้อย่างไร
06/19/2024

ปลดล็อกข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับจีโนมที่มีประสิทธิภาพด้วย AWS HealthOmics Analytics และ Amazon EMR
05/30/2024

การควบคุมระบบเวิร์กโฟลว์ AWS HealthOmics หลายรายการตามขนาด
05/07/24

ทำให้การวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์เพื่อทุกคนด้วย Basepair บน AWS HealthOmics
04/29/2024

AWS HealthOmics ประกาศความสามารถใหม่สำหรับการบูรณาการที่เก็บข้อมูลและเครื่องมือวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์อย่างราบรื่น
04/17/2024

จัดเก็บข้อมูลโอมิกส์อย่างคุ้มค่าได้ในทุกขนาดด้วย AWS HealthOmics
24/01/24

การประมวลผลข้อมูล fMRI บน AWS โดยใช้ AFNI และ AWS HealthOmics
08/01/24

เครื่องมือใหม่เพื่อเร่งการย้ายเวิร์กโฟลว์ไปยัง AWS HealthOmics
13/12/23

การวิเคราะห์ข้อมูลหลายรูปแบบด้วย AWS Health และบริการแมชชีนเลิร์นนิง
16/10/23

การออกแบบสถาปัตยกรรมที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์สำหรับเวิร์กโฟลว์ชีวสารสนเทศโดยใช้ AWS HealthOmics และ Amazon EventBridge
11/10/23

รักษาความปลอดภัยของเวิร์กโฟลว์และข้อมูลจีโนมของคุณด้วย AWS HealthOmics
10/09/23

วิดีโอ


AWS re:Invent 2024 - ปรับขนาดการดำเนินการวินิจฉัยทางคลินิก: นวัตกรรมจีโนมของ Natera (48:52)


AWS re:invent 2024 - Merck ปรับปรุงการออกแบบยาด้วยแบบจำลองพื้นฐานทางชีวภาพอย่างไร (39:38)


การเอาชนะความท้าทายทางวิทยาศาสตร์และไอทีที่เกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์สเกลโอมิกส์ (22:11)


ปฏิวัติการแพทย์ที่มีความแม่นยำ: Sonrai ใช้ AWS ในการค้นพบยา (3:03)


AWS re:Invent 2023 - นวัตกรรมโอมิกส์กับ AWS HealthOmics: เส้นทางสู่ผลลัพธ์ที่เร็วขึ้นของ Amgen


AWS re:Invent 2023 - การสร้างแพลตฟอร์มการแพทย์ที่แม่นยำโดยใช้ AWS HealthOmics


AWS HealthOmics การประชุมเชิงปฏิบัติการแบบครบวงจร - การนำเสนอ (43:27)


AWS On Air ft. AWS HealthOmics และข้อมูลเปิด (20:07)


การใช้ AWS HealthOmics สำหรับจีโนมแบบครบวงจร (2:03:06)


AWS On Air ft. เวิร์กโฟลว์ Ready2Run บน AWS HealthOmics (26:34)